Ponpes Modern Dzikir Al-Fath didirikan dan dipimpin langsung sekaligus sebagai pengasuhnya adalah KH. M. Fajar Laksana. Cikal bakal Ponpes Modern Dzikir Al-Fath dimulai dengan mendirikan Majelis Dzikir Bashorun Fuadun tahun 1996 sd 2010 di Nangeleng Kota Sukabumi, kemudian dilanjut tahun 2010 mendirikan Ponpes Dzikir Al-Fath yang diresmikan langsung oleh Tokoh Ulama Indonesia KH. Shalahudin Wahid (Gus Solah). Berdiri dibawah Yayasan Al-Fath dengan Akta Pendirian Yayasan Alfath notaris Cahya Ningsih Tedjwisastra,S.H.,M.Kn tanggal 10 Juni 2010 Nomor : 1, kemudian mengalami pembaruan dengan Akta Perubahan Yayasan Al-Fath notaris Faber, SH. tanggal 15 februari 2023 Nomor : 05, Kemenkumham RI Nomor : AHU.AH.01.06-0008282.
Selanjutnya Ponpes Modern Dzikir Al-Fath membuat yayasan baru yaitu Yayasan Sukabumi Study Center, Yayasan Irsyad Fatahillah dan Yayasan Museum Prabu Siliwangi.
Ponpes Modern Dzikir Al Fath mendapatkan SK Izin dari Kementrian Agama Kota Sukabumi dengan Nomor : 032 tahun 2018 serta Piagam Izin Operasional dari Kementrian Agama Kota Sukabumi dengan Nomor : 510032710079.